El 16 de julio de 2009 fue fundada la Asociación Civil Real Atlético Garcilaso a iniciativa de los exalumnos del colegio Inca Garcilaso de la Vega, de la ciudad de Cuzco. Se ganó la consideración internacional por su participación en la Copa Bridgestone Libertadores de América en el año 2013, con resonantes triunfos, a expensas de equipos con mucha trayectoria. El Cuzco peruano es un hito histórico. Sin embargo, el Real Garcilaso, se constituye hoy en referencia de identidad.
En poco tiempo, el club miembro, de la Federación Peruana, construyó su local propio y está encarando actualmente la tarea de levantar su estadio.
En la actualidad, Real Garcilaso, es un protagonista excluyente de los torneos oficiales de la FPF, y de la CONMEBOL.
